Kebiasaan baik siswa dan tenaga pendidik dan kependidikan di SMP N 2 Brangsong selalu ditumbuhkan melalui kegiatan pembiasaan. Kegiatan pembiasaan di SMP N 2 Brangsong antara lain:
- Upacara Bendera
- Sholat Dhuha
- Sholat Dzuhur berjamaah
- Membaca surat Yasiin
- Menyapa guru
- Kebersihan kelas dan sekolah
- Literasi harian dan bulanan
- Amal Jumat
- Jalan Sehat / Sepeda santai